数据库交接后因 persist_only 级别的参数设置引发的故障分析。
作者：不吃芫荽，爱可生华东交付服务部 DBA 成员，主要负责 MySQL 故障处理及相关技术支持。
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背景
客户在给系统打补丁之后需要重启服务器，数据库在重启之后，read_only 的设置与标准配置 文件中不一致，导致主库在启动之后无法按照预期写入。
已知并没有外部程序会对数据库做只读的设置，那么会是哪里出了问题？
排查过程
首先，检查启动进程配置文件的内容，是否的确正确配置了 read_only ，有没有在重启前后对文件进行修改：
# 检查配置文件的修改状态
[root@localhost ~]# stat /usr/local/mysql/etc/my.cnf
File: ‘/usr/local/mysql/etc/my.cnf’
Size: 6160 Blocks: 16 IO Block: 4096 regular file
Device: fd00h/64768d Inode: 591296 Links: 1
Access: (0644/-rw-r--r--) Uid: ( 27/ mysql) Gid: ( 27/ mysql)
Access: 2023-12-18 03:47:45.375190686 +0800
Modify: 2022-08-01 23:25:34.861953062 +0800
Change: 2022-08-01 23:25:34.862953087 +0800
Birth: -
# 查看配置文件内对read_only的设置
[root@localhost ~]# cat /usr/local/mysql/etc/my.cnf |grep read_only
[root@localhost ~]#
[root@localhost ~]#
已知数据库版本信息为 8.0.25 ，近期没有修改过配置文件，文件也没有对 read_only 进行配置，默认配置为 OFF ：
其次，查看所有可能读取的配置文件，并逐个排查：
# 1. 查看 mysql 配置文件默认的加载顺序
[root@localhost ~]# mysql --verbose --help | grep -A 1 'Default options'
Default options are read from the following files in the given order:
/etc/my.cnf /etc/mysql/my.cnf /usr/local/mysql/etc/my.cnf ~/.my.cnf
# 2. 依次查看可能会存在的配置文件，及其配置的 read_only 值
[root@localhost ~]# ll /etc/my.cnf
ls: cannot access /etc/my.cnf: No such file or directory
[root@localhost ~]# ll /etc/mysql/my.cnf
ls: cannot access /etc/mysql/my.cnf: No such file or directory
# /usr/local/mysql/etc/my.cnf 为本实例启动时的指定配置文件，配置见上文，此处略
[root@localhost ~]# ll ~/.my.cnf
-r-------- 1 root root 355 Aug 19 2021 /root/.my.cnf
[root@localhost ~]# cat .my.cnf |grep read_only
[root@localhost ~]#
[root@localhost ~]# ll /home/mysql/.my.cnf
ls: cannot access /etc/my.cnf: No such file or directory
# 3. 通过检查服务器上可能存在的配置文件，发现 read_only 的设置在以上文件内并不存在
以上查看配置文件 的配置并没有找到相关配置，那么还有什么办法呢？尝试看看对数据库的历史操作记录，确认是否有用户对数据库做过 read_only 配置的操作：
# 通过 /root/.mysql_history ，看到这样的历史记录：
set PERSIST_ONLY read_only = 1;
全局模糊搜索配置文件，发现了 mysqld-auto.cnf 文件：
[root@localhost ~]# find / -name '*my*cnf'
/root/my.cnf
/root/.my.cnf
/usr/share/mysql/README.mysql-cnf
/usr/share/mysql/my-huge.cnf
/usr/share/mysql/my-innodb-heavy-4G.cnf
/usr/share/mysql/my-large.cnf
/usr/share/mysql/my-medium.cnf
/usr/share/mysql/my-small.cnf
/usr/local/mysql/support-files/my.cnf
/usr/local/mysql/etc/my.cnf
/data/mysql/mysqld-auto.cnf
# 查看 mysqld-auto.cnf 文件内容，以及文件的操作时间
[root@localhost ~]# cat /data/mysql/mysqld-auto.cnf
{ "Version" : 1 , "mysql_server" : { "read_only" : { "Value" : "ON" , "Metadata" : { "Timestamp" : 1659045255269856 , "User" : "root" , "Host" : "localhost" } } } }
# 时间戳转换为北京时间 【1659045255269856】 -- >【2022-07-29 05:54:15】
# 查看 mysqld-auto.cnf 文件的状态
[root@localhost ~]# stat /data/mysql/mysqld-auto.cnf
File: ‘/data/mysql/mysqld-auto.cnf’
Size: 164 Blocks: 8 IO Block: 4096 regular file
Device: fd08h/64776d Inode: 6291467 Links: 1
Access: (0640/-rw-r-----) Uid: ( 27/ mysql) Gid: ( 27/ mysql)
Access: 2023-12-19 11:48:42.511662204 +0800
Modify: 2022-07-29 05:54:15.269682214 +0800
Change: 2022-07-29 05:54:15.269682214 +0800
Birth: -
这套数据库之前由别的团队管理，根据 mysql_history 的操作记录、前后带有时间记录的业务查询、以及 mysqld-auto.cnf 文件的生成时间，这些时间在我们接管之前，接管时仅检查了当时的数据库状态、my.cnf 文件中的配置，非常怀疑是这个操作导致了启动之后 read_only 被开起来，导致业务无法按照预期写入，接下来我们对这个参数进行测试。
参数测试
在主库设置参数。
# 配置文件检查
[root@localhost etc]# cat my.cnf |grep read_only
read_only = 0
super_read_only = 0
# 参数检查：
mysql> select @@read_only,@@super_read_only;
+-------------+-------------------+
| @@read_only | @@super_read_only |
+-------------+-------------------+
| 0 | 0 |
+-------------+-------------------+
1 row in set (0.00 sec)
# 设置参数
mysql> set PERSIST_ONLY read_only = 1;
Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
查看重启后的参数变化。
# 重启数据库
[root@localhost ~]# systemctl restart mysqld_3301
# 查看参数：
mysql> select @@read_only,@@super_read_only;
+-------------+-------------------+
| @@read_only | @@super_read_only |
+-------------+-------------------+
| 1 | 0 |
+-------------+-------------------+
1 row in set (0.00 sec)
通过 strace 来查看数据库在启动时读取了哪些配置文件，以下是相关配置片段：
15:56:34.828260 stat("/opt/mysql/etc/3301/my.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=5042, ...}) = 0 <0.000008>
15:56:34.829061 stat("/opt/mysql/data/3301/mysqld-auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=164, ...}) = 0 <0.000006>
15:56:35.154154 stat("/opt/mysql/data/3301/auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=56, ...}) = 0 <0.000008>
15:56:35.154228 stat("/opt/mysql/data/3301/auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=56, ...}) = 0 <0.000007>
15:56:35.172411 stat("/opt/mysql/data/3301/auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=56, ...}) = 0 <0.000007>
15:56:35.172441 stat("/opt/mysql/data/3301/auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=56, ...}) = 0 <0.000007>
15:56:35.174142 stat("/opt/mysql/data/3301/mysqld-auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=164, ...}) = 0 <0.000007>
15:56:35.174172 stat("/opt/mysql/data/3301/mysqld-auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=164, ...}) = 0 <0.000007>
15:56:35.357608 stat("/opt/mysql/data/3301/auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=56, ...}) = 0 <0.000011>
15:56:35.357643 stat("/opt/mysql/data/3301/auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=56, ...}) = 0 <0.000010>
15:56:35.360019 stat("/opt/mysql/data/3301/mysqld-auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=164, ...}) = 0 <0.000009>
15:56:35.360052 stat("/opt/mysql/data/3301/mysqld-auto.cnf", {st_mode=S_IFREG|0640, st_size=164, ...}) = 0 <0.000008>
测试结论
根据以上排查过程和测试，数据库在启动时，读取完启动时指定的配置文件，会去读 mysqld-auto.cnf 这个文件，的确是这个参数设置导致 read_only 与标准配置文件预期不符的。
官网说明补充
官网搜索 PERSIST_ONLY ，这个操作会将设置写入 mysqld-auto.cnf ，也可以通过 RESET PERSIST 来删除写入此文件的配置。
官方描述还提到，配置文件需要登录 MySQL 的服务器去修改，而且 SET GLOBAL 的操作是运行时功能，无法持久化到数据库运行依据的配置文件 ，更不会延续到后续的配置，因此提供了 PERSIST 的 SET 语法变体，来将系统变量设置保存到 mysqld-auto.cnf 中。
The MySQL server maintains system variables that configure its operation. A system variable can have a global value that affects server operation as a whole, a session value that affects the current session, or both. Many system variables are dynamic and can be changed at runtime using the SET statement to affect operation of the current server instance. SET can also be used to persist certain global system variables to the mysqld-auto.cnf file in the data directory, to affect server operation for subsequent startups. RESET PERSIST removes persisted settings from mysqld-auto.cnf.
关于在 Unix 类操作系统中配置文件的读取顺序，我们也可以了解一下，mysqld-auto.cnf 也在其中：
